최고의 스파이와 냉혈한 처단자, 그들의 목적은 단 하나다!

도시의 범죄자를 처단하는 퍼니셔(프랭크 캐슬)와 최고의 스파이 블랙 위도우(나타샤 노마노프). 어울릴 것 같지 않은 두 파트너가 세상에서 가장 치명적인 범죄조직인 리바이어던의 비밀 기지로 잠입한다. 한 때 쉴드(S.H.I.E.L.D.) 소속의 과학자이자 블랙 위도우의 연인이었지만 지금은 리바이어던과 손을 잡은 엘라이어스는 쉴드 요원들의 DNA를 몰래 빼돌려 대규모의 신체 강화군인을 양성하고 있었다. 한편 사악한 케인의 계략으로 세뇌당한 퍼니셔가 통제 불가능의 상태에서 쉴드의 요원들을 사살한다. 이 사건으로 퓨리 국장은 퍼니셔를 격리시키지만 블랙 위도우는 모든 책임을 감수하고 그와 남은 임무를 마치기로 한다. 마드리 폴에서 최신 무기경매가 있다는 정보를 입수한 퍼니셔와 블랙 위도우는 ‘바이오 솔져’라고 부리는 신체 강화군인과 맞서고, 이들을 돕기 위해 어벤져스도 출동하는데…